中國農業(yè)科學院深圳農業(yè)基因組研究所（簡稱"基因組所"）成立于2014年，由農業(yè)農村部、中國農業(yè)科學院和深圳市政府共同支持建設?；蚪M所通過整合生物學和大數據科學，來認識與利用農業(yè)生物基因組，服務全球農業(yè)生產。為此，基因組所成立了組學技術、合成生物學、植物基因組、動物基因組、生態(tài)基因組、食品科學等研究中心和相關技術平臺。基因組所的長期愿景是致力于通過顛覆性創(chuàng)新來促進全球農業(yè)可持續(xù)發(fā)展，服務于個性化食品供給體系，并提升人類健康水平和農民社會地位！

成立以來，基因組所深入貫徹落實習近平總書記"四個面向、兩個一流"指示精神，開展科研自主權改革試點工作，被列為中國農科院現代院所改革的"試驗田"，建立了由中國農科院與深圳市主管領導任共同理事長的理事會；組建了近800人的研究隊伍；形成了以組學技術為核心、輻射農業(yè)、食品和生態(tài)方向的學科體系，獲批"嶺南現代農業(yè)科學與技術廣東省實驗室深圳分中心""農業(yè)農村部農業(yè)基因數據分析重點實驗室"等創(chuàng)新載體；在包括 Science、Nature、Cell 等頂級期刊在內的雜志上發(fā)表SCI論文400多篇，以基因組設計育種育成國審、省審新品種30余個，農業(yè)基因組學等研究領域占據世界前沿。2019年、2020年連續(xù)兩年自然指數排名全國農業(yè)類科研院所第一名，多項成果入選"'十三五'農業(yè)科技十大標志性成果""中國生命科學十大進展""中國農業(yè)科學十大進展"。先后獲得"何梁何利基金"獎、"周光召基礎科學獎""深圳經濟特區(qū)建立40周年創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)和先進模范人物""深圳市市長獎"等獎勵。

目前，基因組所聯(lián)合深圳市相關部門提出了"深圳國際食品谷"，規(guī)劃已得到市政府印發(fā)，將構建農業(yè)食品產學研協(xié)作生態(tài)，做出科技推動農業(yè)食品產業(yè)轉型升級的先行示范