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更新于 10月21日

腸道微生態(tài)專(zhuān)職人員

6000-10000元
  • 太原萬(wàn)柏林區(qū)
  • 3-5年
  • 碩士
  • 全職
  • 招1人

職位描述

微生物工程
需要一位“既能獨(dú)立開(kāi)發(fā)新腳本、又能按時(shí)交報(bào)告”
1、英語(yǔ)讀寫(xiě)無(wú)障礙,生物學(xué)、微生物學(xué)、生物信息學(xué)、醫(yī)學(xué)等相關(guān)專(zhuān)業(yè)。
2、具有完整的微生物組學(xué)項(xiàng)目實(shí)戰(zhàn)(16S、宏基因組、代謝組),課題或正式工作均可計(jì)入;
3、累計(jì)處理樣本數(shù)≥100例或測(cè)序數(shù)據(jù)≥500 Gb。
4、編程與流程:熟練掌握R/Python/C++/Shell/Perl/Script語(yǔ)言,能隨手改腳本;熟悉Snakemake或Nextflow加分;
5、組學(xué)分析:從原始fastq到物種/功能注釋、差異統(tǒng)計(jì)、可視化,一條龍獨(dú)立跑通;知道質(zhì)控陷阱(宿主污染、批次效應(yīng))并能現(xiàn)場(chǎng)解決;
6、數(shù)據(jù)庫(kù)與系統(tǒng):熟練操作Linux集群,能在命令行完成blast、KEGG、eggNOG注釋?zhuān)皇煜CBI/GMrepo/EBI等微生物組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的使用。
7、 實(shí)驗(yàn)銜接與生物學(xué)翻譯
(1)至少知道糞便樣本采集、DNA提取、PCR抑制因子清除等基本濕實(shí)驗(yàn)痛點(diǎn),能和實(shí)驗(yàn)同事對(duì)上話;
(2)能把“LEfSe柱狀圖”翻譯成例如“某菌產(chǎn)丁酸可能通過(guò)GPR43改善胰島素敏感性”這類(lèi)客戶/醫(yī)生聽(tīng)得懂的機(jī)制假設(shè)。
8、 交付與輸出標(biāo)準(zhǔn)
(1)接到數(shù)據(jù)后≤5個(gè)工作日輸出標(biāo)準(zhǔn)分析報(bào)告(含方法、圖表、結(jié)論、方法學(xué)局限);
(2)報(bào)告模板可自動(dòng)生成(R Markdown或Python Notebook),一鍵導(dǎo)出PDF/PPT;
(3)能根據(jù)客戶追問(wèn)快速做個(gè)性化挖掘(ROC、隨機(jī)森林、WGCNA、多組學(xué)關(guān)聯(lián)),不排斥“再來(lái)一遍”的迭代。
9、學(xué)術(shù)/產(chǎn)業(yè)影響力(同等加分)
(1)以第一或共一發(fā)表過(guò)微生物組SCI,或署名發(fā)明專(zhuān)利/軟件著作權(quán)≥1項(xiàng);
(2)熟悉臨床樣本管理和IVD申報(bào)流程,能寫(xiě)注冊(cè)用生信部分資料;
(3)有糞菌移植、益生菌/活體生物藥項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),知道GMP級(jí)別數(shù)據(jù)分析要求。

工作地點(diǎn)

太原萬(wàn)柏林區(qū)華潤(rùn)大廈-T7棟26層

職位發(fā)布者

伍女士/人事主管

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